●2001年9月14日，上海合作组织成员国总理在哈萨克斯坦的阿拉木图举行首次成员国政府首脑理事会议。六国总理一致决定启动六国多边经贸合作进程，签署了《上海合作组织成员国政府间关于开展区域经济合作的基本目标和方向及启动贸易和投资便利化进程的备忘录》，宣布正式建立上海合作组织框架内的总理定期会晤机制，并发表了《上海合作组织成员国政府总理第一次会晤新闻公报》。

●2003年9月23日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第二次会议在北京举行。签署了《上海合作组织成员国多边经贸合作纲要》《关于技术性启动上海合作组织常设机构的备忘录》《上海合作组织成员国总理会晤联合公报》等六个文件。

●2004年9月23日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第三次会议在吉尔吉斯斯坦首都比什凯克举行。与会领导人一致强调，要通过多边和双边合作坚决打击恐怖主义、分裂主义、极端主义“三股势力”。

●2005年10月26日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第四次会议在俄罗斯首都莫斯科举行。会议签署了《上海合作组织成员国政府间救灾互助协定》等文件。

●2006年9月15日， 上海合作组织成员国政府首脑理事会第五次会议在塔吉克斯坦首都杜尚别举行。六国总理结合同年6月15日上海峰会达成的共识，提出了六国在经贸、科技、社会、文化和其他领域合作的一系列具体措施。

●2007年11月2日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第六次会议在乌兹别克斯坦首都塔什干举行。会议签署了《上海合作组织成员国政府海关合作和互助协定》。

●2008年10月30日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第七次会议在哈萨克斯坦首都阿斯塔纳举行。与会领导人就各方关心的涉及本组织发展问题交换了意见。

●2009年10月14日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第八次会议在北京举行。会议取得突出成果，会议发表了《2009年上海合作组织成员国政府首脑（总理）理事会会议联合公报》，批准了《上海合作组织成员国关于加强多边经济合作、应对全球金融经济危机、保障经济持续发展的共同倡议》。

●2010年11月25日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第九次会议在塔吉克斯坦首都杜尚别举行。各国领导人一致同意加大打击“三股势力”力度，切实维护本地区的安全与稳定；加强经济政策协调，促进贸易投资便利化，加快实施经济技术合作项目；深化救灾、教育、文化等领域合作，促进本地区可持续发展。

●2011年11月7日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第十次会议在俄罗斯圣彼得堡举行。会议通过了《上合组织成员国政府首脑（总理）关于世界和上合组织地区经济形势的联合声明》。

●2012年12月4日至5日，上海合作组织成员国政府首脑理事会第十一次会议在吉尔吉斯斯坦比什凯克举行。会议结束后上合组织成员国签署了多项重要文件。

●2013年11月28日至29日，上海合作组织成员国政府首脑（总理）理事会第十二次会议在塔什干举行。中华人民共和国国务院总理李克强同与会各国领导人就促进上合组织框架内多领域合作、加强上合组织建设等深入交换意见，达成广泛共识（图③）。

●2014年12月14日至15日，上海合作组织成员国政府首脑（总理）理事会第十三次会议在阿斯塔纳市举行。中华人民共和国国务院总理李克强同与会各国领导人就进一步深化上合组织务实合作深入交换意见（图④）。总理们通过了《上海合作组织秘书处关于〈上海合作组织成员国多边经贸合作纲要〉落实情况的报告》。

●2015年12月，上海合作组织成员国政府首脑理事会第十四次会议将于14日至15日在河南省郑州市举行。